El control de las redes dentro el sistema autónomo es un trabajo difícil y pesado de mantener, de los cuales pueden ser grandes o pequeños. El protocolo interno utilizado en cada sistema autónomo en ocasiones no es el adecuado, presentando fallas en el envío de información a sus vecinos, conflictos existentes en la red, como ser routers, sistemas caídos o problemas que se pueden presentar en la red.